بررسی چگونگی مکانیسم عمل فتوپروتئین های حساس به کلسیم با توجه به خواص دینامیک ساختاری

پایان نامه
چکیده

پروتئین های لومینسانس، ابزارهای ارزشمندی با کاربردهای فراوان می باشند. تحقیقات مولکولی روی دو گروه پروتئین های بیولومینست، لوسیفرازها و فتوپروتئین ها متمرکز شده است و از بین فتوپروتئین های بیولومینست، خانواده کلنترات بیشترین توجه را به خود جلب نموده است. علاوه بر این خانواده، فتوپروتئین های گروه کتنوفور نیز در حال بررسی است. اخیرا ژن فتوپروتئین نمیوپسین از گونه نمیوپسیس لیدی جدا شده است. در این تحقیق، جهت شناخت بیشتر عملکرد فتوپروتئین نمیوپسین دو جهش n105w با توجه به تریاد کاتالیک his16, tyr82, trp86 در اطراف حلقه اول در موقعیت کربن 6 و جهش s128g با در نظر گرفتن اهمیت شبکه پیوند هیدروژنی در اطراف حلقه 2 کلنترازین در فتوپروتئین های کلنترات، انتخاب شدند. موتانت n105w هیچ گونه فعالیتی از خود نشان نمی دهد و این در حالی است که موتانت s128g در مقایسه با فتوپروتئین طبیعی کاهش چشم گیری در فعالیت نشان می دهد. برای پی بردن به عامل موثر بر این تغییرات، شبیه سازی دینامیک مولکولی استفاده و نتایج حاصل با نتایج به دست آمده از شبیه سازی اکورین های سمی سنتتیک مقایسه شد. نتایج نشان می دهد که کاهش فعالیت در موتانت s128g می تواند مربوط به تغییرات حرکات ساختاری کلنترازین و ناحیه حفره و نیز تغییر در میانکنش لیگاند و پروتئین باشد. با توجه به نتایج حاصل می توان اینگونه بیان کرد که خواص دینامیک ساختاری پروتئین و لیگاند، نقش مهمی در فعالیت فتو پروتئین ها بازی می کند و خصوصیات نشر نوری از پارامتر مختلفی تاثیر می پذیرند.

منابع مشابه

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

متن کامل

بررسی ویژگی های ساختاری تیتانات کلسیم به روش شبیه سازی

متن کامل

بررسی و مطالعه مکانیزم عمل بیولومینسانسی فتوپروتئین های وابسته به کلسیم با استفاده از جهش زایی هدف دار و مطالعه دینامیک ملکولی

فتوپروتئینها گروهی از پروتئین های بیولومینسانس می باشند که دارای اهمیت و کاربردهای فراوانی در علوم مختلف هستند. از این رو تحقیقات گسترده ای برای درک مکانیسم این پروتئینها جهت بهینه کردن فعالیت آنها در حال انجام است. در این تحقیق، جهت شناخت بیشتر عملکرد فتوپروتئین نمیوپسین دو جهش leu36his و phe186his انتخاب شدند. از این گروه می توان به کلنترات، کتنفور و شعاعیان اشاره کرد که دارای تشابهات ساختاری...

15 صفحه اول

بررسی مکانیسم اثر ورزش بر افزایش پاسخ در عروق پوستی موش صحرایی: نقش نیتریک اکساید، کانال های پتاسیمی حساس به کلسیم و کانال های پتاسیمی حساس به atp

تمرینات منظم ورزشی اثرات درمانی و محافظتی در برابر عوارض متعدد حاصل از بیماری های مختلف دارند، همچنین حساسیت اندوتلیال را در برابر محرک های رها کننده میانجی های اندوتلیال که مهمترین آنها نیتریک اکساید است را افزایش می دهند. علاوه بر این بعضی از مطالعات نشان می دهند که ورزش در عروق کرونری به طور عمده اثر وازودیلاتوری خود را از طریق افزایش تعداد کانال های پتاسیمی حساس به کلسیم اعمال می کند، از طر...

مکانیسم عمل پنی سیلین

متن کامل

اصلاح شبکه مبدل های حرارتی با توجه به محدودیتهای ساختاری و هیدرودینامیکی موجود : روش جدید هدفگذاری

در این مقاله یک روش جدید هدفگذار اصلاحی شبکه مبدل های حرارتی ، مبتنی بر فن آوری پینچ ارائه گردیده که در هنگام هدفگذاری ساختار سیستم هیدرودینامیکی شبکه موجود را به عنوان دو قید اصلی و به طور همزمان در نظر می گیرد . این روش برای لحاظ کردن ساختار شبکه موجود از یک مدل برنامه ریزی خطی استفاده می نماید . این مدل طی فرایند بهینه سازی شبکه ای را پیدا می کند که حداکثر سازگاری را با شبکه موجود داشته باشد...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023